统领伯克岛的酋长嗝嗝，与阿丝翠德共同打造了一个奇妙而热闹的飞龙乌托邦。而一只雌性光煞飞龙的意外出现，加上一个前所未有的威胁的到来，令嗝嗝和没牙仔不得不离开自己唯一的家园，前往他们本以为只存在于神话之中的隐秘之境。在发现自己真正的命运之后，飞龙与骑士将携手殊死奋战，保护他们所珍爱的一切。

京岛国的少年小嗝嗝是部落统领伟大的斯托里克的儿子，他非常想像自己的父亲一样亲手屠龙——这些飞龙是岛上维京人放牧羊群的主要天敌——但他每次出现在部落屠龙的战斗中都只给大家徒增烦恼。在一次对抗飞龙的战斗中，希卡普偷偷用射龙器击伤了一只最神秘的“夜之怒龙”，并背着族人放生、豢养，甚至驯服了这只龙，还给它起名“无牙”。希卡普的神秘行径引起了一同训练屠龙技巧的女孩阿斯特丽德的怀疑。阿斯特丽德发现了希卡普的秘密，却同时被身骑“无牙”御风而飞的美妙体验所震撼。格雷决定在屠龙成人礼上向远征归来的斯托里克和族人讲明真相，说服大家放弃屠龙，却偏偏弄巧成拙，害得“无牙”被俘，一场更大的灾难就在眼前。

故事发生在巨龙回归隐秘世界1300年后。在现代，龙只是神话传说中的生物。然而，一场巨大的地壳运动导致地球偏远地区出现一条巨大的裂缝。一群性格各异的孩子，与他们的科学家父母一起生活在裂缝附近的研究实验室里，发现了一个惊人的秘密——龙是真实存在的……而且它们又回来了。这条裂缝打开了通往隐秘世界的入口，现在，这些孩子将结识并训练他们自己的新龙，探索隐秘世界的全新领域，同时努力向世界保守这些秘密。